Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkain3Q3URJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkain3Q3URJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nkain3Q3URJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms