Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd27Q3UMR0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd27Q3UMR0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd27Q3UMR0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd27Q3UMR0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd27Q3UMR0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd27Q3UMR0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd27Q3UMR0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd27Q3UMR0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd27Q3UMR0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms