Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330014E10RikQ3UL33 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms