Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccser2Q3UHI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser2Q3UHI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccser2Q3UHI0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccser2Q3UHI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser2Q3UHI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser2Q3UHI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms