Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brf2Q3UAW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brf2Q3UAW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brf2Q3UAW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brf2Q3UAW9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brf2Q3UAW9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brf2Q3UAW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brf2Q3UAW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms