Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms