Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VwceQ3U515 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VwceQ3U515 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms