Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srebf2Q3U1N2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srebf2Q3U1N2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srebf2Q3U1N2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms