Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hhla1Q3TYV2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hhla1Q3TYV2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hhla1Q3TYV2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms