Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc10Q3TLI0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc10Q3TLI0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc10Q3TLI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms