Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim43aQ3TL54 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43aQ3TL54 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms