Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdlim7Q3TJD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdlim7Q3TJD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms