Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RubcnlQ3TD16 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnlQ3TD16 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnlQ3TD16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms