Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riiad1Q3KNY5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Riiad1Q3KNY5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riiad1Q3KNY5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms