Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1rd19Q3KNP5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V1rd19Q3KNP5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
V1rd19Q3KNP5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1rd19Q3KNP5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1rd19Q3KNP5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms