Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ptchd1Q14B62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ptchd1Q14B62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ptchd1Q14B62 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ptchd1Q14B62 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ptchd1Q14B62 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ptchd1Q14B62 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ptchd1Q14B62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ptchd1Q14B62 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms