Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf3ip1Q149C2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf3ip1Q149C2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf3ip1Q149C2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms