Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Rundc1Q0VDN7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rundc1Q0VDN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms