Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cib3Q0P523 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms