Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NeblQ0II04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NeblQ0II04 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeblQ0II04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeblQ0II04 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms