Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MitfQ08874 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MitfQ08874 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MitfQ08874 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MitfQ08874 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MitfQ08874 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MitfQ08874 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MitfQ08874 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms