Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1Q04750 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1Q04750 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1Q04750 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1Q04750 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top1Q04750 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top1Q04750 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Top1Q04750 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms