Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scg2Q03517 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scg2Q03517 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.6 ms