Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Epha4Q03137 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epha4Q03137 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Epha4Q03137 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms