Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snai1Q02085 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snai1Q02085 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snai1Q02085 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Snai1Q02085 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms