Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Yy1Q00899 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Yy1Q00899 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Yy1Q00899 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms