Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps45P97390 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps45P97390 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps45P97390 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps45P97390 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps45P97390 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps45P97390 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps45P97390 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps45P97390 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps45P97390 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps45P97390 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps45P97390 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps45P97390 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms