Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx1P80205 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx1P80205 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms