Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp4P70343 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp4P70343 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp4P70343 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp4P70343 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp4P70343 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp4P70343 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms