Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frat1P70339 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frat1P70339 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frat1P70339 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frat1P70339 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frat1P70339 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Frat1P70339 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frat1P70339 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frat1P70339 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frat1P70339 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms