Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hmgb1P63158 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgb1P63158 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms