Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtnP63089 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtnP63089 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtnP63089 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtnP63089 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtnP63089 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtnP63089 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtnP63089 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtnP63089 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtnP63089 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtnP63089 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtnP63089 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtnP63089 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtnP63089 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtnP63089 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtnP63089 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtnP63089 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtnP63089 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtnP63089 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtnP63089 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtnP63089 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtnP63089 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtnP63089 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtnP63089 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtnP63089 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtnP63089 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtnP63089 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtnP63089 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtnP63089 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtnP63089 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtnP63089 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtnP63089 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtnP63089 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtnP63089 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtnP63089 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtnP63089 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtnP63089 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtnP63089 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtnP63089 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtnP63089 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtnP63089 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtnP63089 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtnP63089 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtnP63089 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtnP63089 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtnP63089 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtnP63089 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtnP63089 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtnP63089 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtnP63089 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtnP63089 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtnP63089 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtnP63089 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtnP63089 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtnP63089 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtnP63089 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtnP63089 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtnP63089 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtnP63089 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtnP63089 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtnP63089 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtnP63089 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtnP63089 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtnP63089 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtnP63089 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtnP63089 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtnP63089 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtnP63089 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtnP63089 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtnP63089 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms