Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx1P63040 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cplx1P63040 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cplx1P63040 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cplx1P63040 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms