Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2P62838 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2P62838 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms