Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap2s1P62743 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ap2s1P62743 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap2s1P62743 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap2s1P62743 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap2s1P62743 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap2s1P62743 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap2s1P62743 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap2s1P62743 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms