Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl18aP62717 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl18aP62717 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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