Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga11P61622 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga11P61622 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga11P61622 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga11P61622 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga11P61622 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms