Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smg6P61406 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smg6P61406 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smg6P61406 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smg6P61406 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smg6P61406 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smg6P61406 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Smg6P61406 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smg6P61406 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms