Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4P59383 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn4P59383 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4P59383 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4P59383 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4P59383 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms