Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp5P56399 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp5P56399 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp5P56399 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp5P56399 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp5P56399 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms