Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad23bP54728 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad23bP54728 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad23bP54728 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad23bP54728 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rad23bP54728 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad23bP54728 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rad23bP54728 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rad23bP54728 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad23bP54728 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad23bP54728 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rad23bP54728 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rad23bP54728 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rad23bP54728 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rad23bP54728 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad23bP54728 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad23bP54728 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rad23bP54728 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rad23bP54728 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rad23bP54728 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rad23bP54728 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad23bP54728 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms