Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa11P50709 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms