Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa11P50709 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa11P50709 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa11P50709 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa11P50709 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms