Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc3P49135 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc3P49135 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc3P49135 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms