Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox2P48432 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox2P48432 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox2P48432 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox2P48432 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox2P48432 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms