Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl13P47963 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms