Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfkmP47857 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PfkmP47857 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PfkmP47857 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfkmP47857 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PfkmP47857 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PfkmP47857 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PfkmP47857 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PfkmP47857 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms