Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmx3P42581 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmx3P42581 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmx3P42581 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmx3P42581 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmx3P42581 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmx3P42581 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx3P42581 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx3P42581 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmx3P42581 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms