Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fen1P39749 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fen1P39749 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fen1P39749 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fen1P39749 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fen1P39749 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms