Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tjp1P39447 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tjp1P39447 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tjp1P39447 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.3 ms