Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hspa9P38647 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hspa9P38647 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hspa9P38647 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hspa9P38647 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hspa9P38647 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms